2022-01-01から1年間の記事一覧

ファイル圧縮まとめ(Linux, tar, )

tarコマンドでのディレクトリの圧縮(tar.gzを基本に記述) 圧縮: tar zcvf xxx.tar.gz xxx/ ※tar.bz2の場合、zcvf→jcvf, tar.xzの場合、zcvf→Jcvf 展開: tar zxvf xxx.tar.gz ※tar.bz2の場合、zxvf→jxvf, tar.xzの場合、zxvf→Jxvf 内容を見る:tar ztf xxx.…

LigParGenのバージョンエラーの解決

LigParGenのバージョンエラーの解決のまとめ [エラー1] LBCC converter is activated1 molecule converted89 audit log messages Traceback (most recent call last): File "lLigParGen", line 11, in <module> load_entry_point('LigParGen==2.1', 'console_script</module>…

異なる複数のシェルスクリプトを並列化(バックグラウンド実行せず)

バックグラウンド並列が使えない状態で、異なる複数のシェルを実行する方法を紹介する。 以下の内容をシェルに記述して実行。 JOB_N=5#############################cat <<'EOF' > branch.sh#!/bin/bash if [ $1 -eq 1 ]; then sh job1.shelif [ $1 -eq 2 ];…

gromacsのインストール

メモ tar zxvf fftw-3.3.8.tar.gz cd fftw-3.3.8 ./configure --prefix=/home/local --enable-float --enable-sse --enable-shared make make -j8 install cd .. rm -r gromacs-2019.4 tar zxvf gromacs-2019.4.tar.gz cd gromacs-2019.4 mkdir build cd bui…

シェルスクリプトでのpythonの実行

ファイルを新たに作らず、pythonをシェルスクリプトで実行するためのメモ。 #!/bin/bash pscr=`cat << EOS for i in range(0,10): print("hello") EOS` python3 -c "$pscr" メモ2:最後の""が重要忘れずに。